1.答案：A
解析：根据材料信息“指导中华民族两千多年来的国家治理”并结合所学知识可知，汉武帝“罢黜百家，独尊儒术”后，儒家思想长期居于主导地位，为历代王朝所推崇，A项正确；BCD项思想与“指导中华民族两千多年来的国家治理”不符，排除BCD项。故选A项。
2.答案：A
解析：根据“由此为政治和文化的统一建立了经济基础”可知，材料强调大运河的修建，便利了中国南北贸易的发展，为统一奠定了经济基础，A项正确；便利北方地区粮食向南运输与题干材料“尤其是来自长江地区的稻米和其他粮食作物可以大量地供应北部地区的居民”不符，排除B项；CD项材料信息无法体现，排除。故选A项。
3.答案：D
解析：根据所学知识，元的统一，结束了唐末以来国家分裂、战乱频繁的局面，为统一多民族国家的进一步发展奠定了基础，促进了民族的融合。故“游牧文明对农耕文明造成巨大破坏，阻碍了社会经济的发展”不符合史实，D项符合题意；ABC说法正确，排除。故选D项。